{"id":66268,"date":"2019-06-03T11:41:27","date_gmt":"2019-06-03T11:41:27","guid":{"rendered":"http:\/\/www.intoscana.it\/firenze-un-software-bioinformatico-per-leggere-il-dna-in-tempo-reale\/"},"modified":"2020-05-18T09:38:59","modified_gmt":"2020-05-18T07:38:59","slug":"firenze-un-software-bioinformatico-per-leggere-il-dna-in-tempo-reale","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.intoscana.it\/it\/firenze-un-software-bioinformatico-per-leggere-il-dna-in-tempo-reale\/","title":{"rendered":"Firenze, un software bioinformatico per leggere il DNA in tempo reale"},"content":{"rendered":"<p>Un gruppo di ricerca interdisciplinare dell&#8217;<strong>Universit\u00e0 di Firenze<\/strong> ha realizzato \u2013 grazie a un progetto sostenuto dalla <strong>Fondazione AIRC per la ricerca sul cancro<\/strong> \u2013 un nuovo strumento bioinformatico in grado di <strong>rilevare in tempo reale le alterazioni geniche in malattie tumorali,<\/strong> analizzando i dati ottenuti da sequenziatori di <strong>DNA di ultima generazione, basati sui nanopori.<\/strong><\/p>\n<p>I risultati pubblicati sulla rivista <em><strong>Bioinformatics<\/strong> <\/em>sono il frutto del lavoro di ricercatori del <strong>Dipartimento di Ingegneria dell&#8217;informazione, del Dipartimento di Medicina sperimentale e clinica<\/strong>, del Centro di ricerca e innovazione per le malattie mieloproliferative (CRIMM) e della SOD di Diagnostica Genetica dell&#8217;Azienda ospedaliero-universitaria di Careggi.<\/p>\n<p>&#8220;Nella ricerca abbiamo dimostrato \u2013 ha spiegato&nbsp;<strong>Alberto Magi, ricercatore di Bioingegneria elettronica e informatica,<\/strong> che ha coordinato il team insieme ad <strong>Alessandro Maria Vannucchi, docente di Ematologia e responsabile del CRIMM<\/strong> \u2013 che \u00e8 possibile studiare e identificare le<strong> alterazioni del genoma di tumori del sangue con tempi che vanno da 30 minuti a 5-6 ore<\/strong>. Per comprendere la rilevanza del nuovo approccio computazionale e sperimentale e il possibile impatto sull\u2019analisi del genoma \u2013 ha aggiunto Magi \u2013 basta pensare che <strong>con tecniche tradizionali<\/strong> come i microarray o il sequenziamento di seconda generazione <strong>occorrono circa due settimane per ottenere informazioni equivalenti sulla struttura genomica di un tumore&#8221;.<\/strong><\/p>\n<p><strong>&#8220;La caratterizzazione genomica dei tumori \u00e8 di importanza fondamentale<\/strong> \u2013 ha commentato Vannucchi &#8211; sia per comprendere i meccanismi molecolari alla base della loro genesi ed evoluzione, sia per <strong>predire la capacit\u00e0 dei tumori stessi di resistere ai trattamenti farmacologici.<\/strong> Di conseguenza, avere una caratterizzazione genomica in tempi rapidi diventa sempre pi\u00f9 importante per la scelta dei farmaci, per la cosiddetta medicina di precisione&#8221;.<\/p>\n<p>Con i sequenziatori di terza generazione basati su nanopori, le molecole di DNA attraversano un poro di dimensioni nanoscopiche a cui \u00e8 applicata una differenza di potenziale. A questo punto le basi che compongono i filamenti del DNA vengono lette misurando le variazioni di segnale elettrico indotte. <strong>Con questo principio, queste macchine sono in grado di leggere le sequenze di DNA in tempo reale,<\/strong> mentre il sequenziamento \u00e8 in corso. I dati generati sono analizzati dal software elaborato dai ricercatori,<strong> Nano-GLADIATOR<\/strong>, che \u00e8 dunque capace di ricostruire la struttura genomica di un tumore durante il sequenziamento stesso. &#8220;Gi\u00e0 pochi minuti dopo l&#8217;inizio del processo di sequenziamento \u2013 illustra ancora Magi \u2013 siamo in grado di identificare alterazioni genomiche di grandi dimensioni, che coinvolgono decine di milioni di basi, e man mano che i dati vengono prodotti, il nostro software incrementa la risoluzione, cio\u00e8 la capacit\u00e0 di identificare alterazioni sempre pi\u00f9 piccole, raggiungendo la sensibilit\u00e0 delle tecniche tradizionali dopo qualche ora di analisi&#8221;.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>&#8216;NANO-Gladiator&#8217; \u00e8 capace di individuare rapidamente le alterazioni del genoma grazie a sequenziatori di ultima generazione<\/p>\n","protected":false},"author":525,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[475,15],"tags":[353],"class_list":["post-66268","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-innovazione","category-tecnologia","tag-universita-di-firenze"],"acf":[],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO Premium plugin v24.2 (Yoast SEO v25.6) - 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